Meskipun keinginan Sayaka Miki terkabul, konsekuensi tak terduga yang menyertainya membuatnya kewalahan, menyebabkan soul gem miliknya tercemar saat ia menyerah pada keputusasaan dan akhirnya kehilangan kemanusiaannya. Homura Akemi mengungkapkan kepada Kyouko Sakura dan Madoka Kaname nasib akhir dari para magical girl: begitu soul gem mereka tercemar, benda itu akan berubah menjadi Grief Seed, dan mereka terlahir kembali sebagai witch—sebuah kebenaran yang dipelajari Homura hanya dengan mengulang sejarah berkali-kali demi mencegah tragedi Madoka. Kyuubey semakin menambah keputusasaan mereka saat ia mengakui niat aslinya: untuk memanen energi yang tercipta dari para magical girl dan menggunakannya untuk memperpanjang usia alam semesta. Saat ancaman Walpurgisnacht, seorang witch yang sangat kuat, mulai mendekat, Homura sekali lagi bersumpah untuk melindungi Madoka dan dunia dari nasib yang suram. Terjebak di antara menghargai keinginan Homura dan menyelamatkan dunia, manakah yang akan dipilih Madoka pada akhirnya? Mahou Shoujo Madoka★Magica Movie 2: Eien no Monogatari adalah kisah tentang takdir yang tak terelakkan, dan seorang pahlawan tak terduga yang bisa mengubah segalanya.
Duh, cerita Madoka-chan ini selalu sukses bikin hati Yuno nyesek dan gemas sama Kyuubey yang licik itu, pokoknya kalian harus siapkan tisu ya nyaa~ (｡>﹏<｡)
