Di akhir abad ke-19, saat masa-masa kejam periode Bakumatsu berakhir, era Meiji yang baru menandai zaman restorasi bagi Jepang. Dengan perang usai, pahlawan terkenalnya, Hitokiri Battousai, menghilang begitu saja, hanya menyisakan legendanya. Bertahun-tahun kemudian, seorang pengembara yang tampak biasa bernama Kenshin Himura bertemu dengan Kaoru Kamiya, pemilik dojo lokal yang sedang berjuang di Tokyo. Kaoru mengejar seorang yang mengaku sebagai Battousai yang berkeliaran di jalanan, membunuh warga dan polisi tanpa pandang bulu. Lebih jauh lagi, sang pendekar mengaku menggunakan Kamiya Kasshin-ryu—sebuah gaya pedang yang dikembangkan oleh ayah Kaoru yang berakar kuat pada esensi kehidupan, bukan kematian. Kenshin memutuskan untuk membantu Kaoru menjatuhkan penipu itu dan mengembalikan dojo ayahnya. Tanpa diketahui semua orang, Kenshin tidak lain adalah pendekar asli yang namanya masih meneror orang-orang. Meskipun Kaoru akhirnya mengetahui kebenarannya, sumpahnya untuk menebus sejarah pembunuhannya dengan melindungi yang lemah tanpa pertumpahan darah menggerakkannya, dan dia menyambut Kenshin untuk tinggal di dojonya. Namun, cita-cita Kenshin segera ditantang oleh hantu masa lalu dan musuh masa kini.
Wah, ceritanya seru banget tentang samurai legendaris yang mau menebus dosa, nyaa~ (≧∇≦)/