Tersembunyi di pegunungan dekat SMP elit Kunugigaoka, terdapat sebuah gedung kecil terbengkalai yang menjadi tempat bagi para berandalan dan murid buangan dari Kelas 3-E. Dipandang rendah oleh rekan-rekan mereka, para murid di kelas ini tampaknya memiliki sedikit harapan untuk memajukan prestasi akademik mereka. Hal itu berubah ketika pemerintah nasional menugaskan mereka untuk melenyapkan ancaman terbesar bagi planet ini: guru baru mereka.
Setelah sebelumnya menghancurkan bulan, profesor mirip gurita yang dijuluki "Koro-sensei" ini kini mengancam akan menghancurkan Bumi pada bulan Maret tahun depan. Dalam menjalankan misi tersebut, para murid menyadari bahwa membunuhnya lebih mudah diucapkan daripada dilakukan. Koro-sensei tidak hanya mampu bergerak dengan kecepatan hingga Mach 20, tetapi ia juga tahan terhadap hampir semua senjata buatan manusia. Ironisnya, ia juga terbukti sebagai salah satu guru terbaik yang pernah dimiliki Kelas 3-E. Sambil melatih kelas tersebut agar unggul dalam pelajaran sekolah sekaligus keahlian sebagai pembunuh, Koro-sensei yakin bahwa kecerdikan dan tekad pantang menyerah murid-muridnya dapat membawa mereka kembali ke kampus utama.
Melalui berbagai percobaan dan kegagalan, Nagisa Shiota bersama murid-murid Kelas 3-E lainnya harus segera menemukan kelemahan Koro-sensei, karena nasib dunia kini bergantung di tangan mereka.
Belajar sambil mencoba membunuh guru gurita yang super cepat itu kedengarannya sangat menantang dan seru sekali nyaa~ (*´∀`*)