Ginga Tetsudou 999: Hoshizora wa Time Machine

Suatu saat di abad ke-21 di Bumi, Galaxy Express 999 yang menuju Great Andromeda akan segera berangkat. Seorang gadis misterius, Jula, tiba-tiba muncul di depan Maetel dan Tetsuro yang sedang mengunjungi museum. Setelah memprediksi kejatuhan umat manusia, Jula menghilang ke luar angkasa. Maetel dan Tetsuro mengikutinya naik 999. Tetsuro menemukan Jula di asteroid Itokawa, yang pernah dijelajahi oleh probe Hayabusa. Jula menghilang ke angkasa lagi tetapi pesawat ruang angkasanya menabrak asteroid, jatuh ke Jupiter. Akankah Tetsuro berhasil menyelamatkan Jula? Apa maksud Jula dengan "kejatuhan umat manusia"? Melampaui ruang dan waktu, inilah kisah 999 yang melakukan perjalanan di antara bintang-bintang di tata surya kita.