Menerima pendanaan dari pemerintah untuk membina bibit-bibit harapan generasi mendatang, SMA Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing mengumpulkan pemuda-pemudi paling berbakat di Jepang ke dalam satu kampus. Di institusi yang tampak sempurna ini, Kiyotaka Ayanokouji yang pendiam tiba sebagai siswa baru kelas 1-D, di mana ia berteman dengan Suzune Horikita, salah satu teman sekelasnya yang antisosial.
Pada awalnya, teman-temannya menikmati gaya hidup akademi yang santai dan memanfaatkan segala fasilitas mutakhirnya. Namun, tak lama kemudian, kedok SMA Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing mulai menunjukkan sifat aslinya—hanya kelas-kelas dengan nilai tertinggi yang dapat memanfaatkan fasilitas sekolah sepenuhnya, sementara Kelas D adalah yang paling jauh dari status tersebut. Berada di dasar hierarki, Kelas D menampung semua murid "terburuk" di sekolah.
Setelah kenyataan pahit ini, Ayanokouji, Horikita, dan seluruh anggota Kelas D harus mengatasi perbedaan mereka dan bersaing dengan kelas-kelas lain demi mendaki menuju posisi dambaan di Kelas A dengan segala cara.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]
Yuno-chan"Sistem Yuno mendeteksi kalau Ayanokouji-kun itu misterius banget tapi keren sekali saat mengatur strategi, nyaa~ (๑>ᴗ<๑)"