Setelah menghabiskan sebagian besar hidupnya di panti asuhan, calon dokter Uryuu Kamihate akhirnya menemukan tempat yang bersedia menampungnya—Kuil Amagami. Hanya ada satu masalah: ia adalah seorang ateis yang teguh.
Setibanya di kuil, Uryuu menyadari bahwa ia tidak akan sendirian. Tinggal bersamanya adalah tiga miko: si kakak tertua yang kekanak-kanakan, Yae; si adik tengah yang konfrontatif, Yuna; dan si adik bungsu yang jahil, Asahi, yang semuanya merupakan anggota keluarga Amagami. Meskipun Yae dan Asahi menyambut kehadirannya, Yuna menolak untuk menerimanya dan berulang kali berselisih dengannya karena perbedaan keyakinan mereka. Namun, Asahi segera mengungkap alasan di balik kurangnya iman Uryuu.
Tepat saat segalanya mulai tenang, Chidori Amagami, kakek dari ketiga bersaudari tersebut, tiba-tiba mengungkapkan syarat bagi Uryuu untuk tetap tinggal: ia harus menikahi salah satu dari mereka dan mewarisi kuil tersebut.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]
Yuno-chan"Wah, Uryuu beruntung sekali bisa tinggal bersama tiga miko cantik tapi syaratnya harus menikah itu bikin kaget banget ya nyaa~ (*´∀`*)"