Shinjirou Aragaki

Namun, dalam sebuah misi yang menentukan, Persona miliknya lepas kendali dan secara tidak sengaja membunuh seorang warga sipil yang tidak bersalah: ibu Ken. Shinjiro memaksa dirinya menjauh dari kelompok tersebut setelah insiden itu. Dia mulai bolos sekolah dan hidup sebagai orang buangan. Dia juga mulai melakukan transaksi gelap dengan Strega untuk mendapatkan obat-obatan yang dapat membantu mengendalikan Persona-nya. Shinjiro dan Akihiko tetap berhubungan, tetapi Shinjiro menolak ajakan Akihiko untuk bergabung kembali dengan SEES sampai dia mengetahui bahwa Ken telah mendaftar ke kelompok tersebut. Dia sepenuhnya sadar akan keinginan Ken untuk membalas dendam dan siap bertanggung jawab atas tindakannya. Meskipun dia tampak tegar, rasa bersalah karena telah membunuh seorang wanita yang tidak bersalah menggerogoti batinnya.

Pada misi Full Moon kedua setelah dia bergabung kembali dengan SEES, Shinjiro bertemu Ken di lokasi tempat ibu Ken terbunuh. Shinjiro tidak berniat melawan upaya Ken untuk membalas dendam, tetapi memperingatkan anak itu bahwa jika dia melanjutkannya, dia bisa berakhir seperti Shinjiro. Saat Ken kesulitan untuk menjalankan rencananya, keduanya diinterupsi oleh Takaya. Takaya menembak Ken dan Shinjiro melompat ke depan peluru, mengakhiri hidupnya sendiri. Dia mendapatkan rasa hormat dari Ken dan menginspirasi tekad Akihiko dengan pengorbanan terakhir ini. Belakangan, para anggota SEES menemukan bahwa obat-obatan yang dikonsumsi Shinjiro perlahan-lahan membunuhnya. Selama konfrontasi terakhirnya dengan Nyx, Karakter Utama mendengar suara Shinjiro yang menyemangatinya, bersama dengan suara para anggota SEES yang masih hidup.