Nagate Tanikaze

Protagonis utama serial ini. Meskipun kesulitan beradaptasi dengan cara hidup Sidonia dan sering mendapat masalah karena ditolak oleh manusia lain akibat ketidaktahuannya akan hukum dan atribut budaya baru, ia akhirnya menjadi penyelamat, pembela utama, dan pahlawan bagi populasi pesawat luar angkasa seiring waktu. Dia mengemudikan model mecha Guardian yang lebih tua namun mampu bernama "Tsugumori". Berbeda dengan kebanyakan penduduk Sidonia yang direkayasa secara genetik untuk dapat menerima sebagian besar kebutuhan energi mereka melalui fotosintesis dan hanya perlu makan sekali sehari, dia adalah manusia murni yang harus mengonsumsi makanan dalam jumlah yang cukup untuk memenuhi kebutuhan energi dan nutrisinya.

Peringatan Spoiler: Klik Untuk Melihat

Dia adalah klon dari pahlawan Sidonia, Saitou Hiroki, yang merupakan Ace orisinal Sidonia. Ketika dia dikloning, mereka melakukan perubahan pada informasi genetik sehingga dia menjadi abadi sejak lahir, tidak seperti makhluk abadi lainnya yang kemudian dimanipulasi, dan memberinya penyembuhan abnormal yang mungkin menjelaskan kebutuhan untuk mengonsumsi makanan dalam jumlah besar setiap hari untuk metabolisme dan penyembuhannya yang diperpanjang. Dia menerima pelatihan elit sejak kecil agar mampu menghadapi segala jenis lingkungan, situasi, dan bahkan senjata dalam fase prototipe mereka.