Full Metal Panic! The Second Raid

Setelah mengatasi berbagai peristiwa bergejolak, sersan tentara bayaran Sousuke Sagara dari Mithril dan gadis sekolah "Whispered" Kaname Chidori kembali ke kehidupan SMA normal mereka. Sousuke melanjutkan upayanya untuk berasimilasi dengan populasi sipil dan mengelola misinya pada saat yang sama, sementara Kaname berusaha mendukung usahanya (meskipun tingkah lakunya sering membuatnya kesal). Namun, seiring kehidupan mereka mereda, masalah baru mulai muncul. Munculnya organisasi teroris independen yang dikenal sebagai Amalgam dan konflik internal di dalam Mithril mengancam akan menghancurkan persatuan menjadi serangkaian kegagalan dan pengkhianatan. Dan model Arm Slave baru yang kuat hanya memperburuk situasi ketika perdamaian dunia dipertaruhkan. Saat Kaname dan Sousuke menghadapi pertempuran batin mereka sendiri di tengah pertarungan yang mengancam jiwa, akankah mereka mampu membuat pilihan yang tepat dan mengubah masa depan mereka?