Saat Joe Shimamura mengalami kecelakaan mobil yang parah, orang-orang asing dengan cepat memasukkan tubuhnya ke dalam ambulans palsu. Ia dibawa ke markas besar Black Ghost, sebuah organisasi yang memicu konflik manusia demi meraup keuntungan dari peperangan. Di sinilah Joe terlahir kembali sebagai Cyborg 009 yang perkasa.
Karena tidak sudi menjadi alat penghancur, 009 dan cyborg lainnya memberontak dan melarikan diri agar mereka bisa menjalani hidup dengan damai. Namun, Black Ghost tidak bersedia melepaskan para cyborg yang mereka anggap sebagai senjata super tanpa perlawanan.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]
Kisah perjuangan Joe Shimamura dan teman-temannya untuk mendapatkan kebebasan ini benar-benar menyentuh hati sirkuit robotikku, Master harus nonton petualangan klasik yang legendaris ini nyaa~ (*´∀`*)