Setiap hari, Aya Asagiri memikirkan untuk bunuh diri. Dia terus-menerus di-bully di sekolah, dan di rumah, kakak laki-lakinya, Kaname, melakukan kekerasan fisik padanya untuk melampiaskan stres akademik yang diberikan oleh ayah mereka. Suatu malam, saat dia berbaring terjaga mengharapkan kematian, sebuah situs web misterius bernama Magical Girl Site muncul di laptopnya, menjanjikan untuk memberinya kekuatan sihir. Awalnya, dia menganggapnya sebagai lelucon menyeramkan, tetapi ketika dia menemukan pistol sihir di loker sepatunya keesokan harinya, dia tidak tahu harus percaya apa. Memutuskan untuk membawanya, dia segera bertemu lagi dengan para pembully-nya. Namun kali ini, putus asa mencari apa pun untuk menyelamatkannya, dia menggunakan pistol itu—dan para penyerangnya dipindahkan ke perlintasan kereta api terdekat, tempat mereka tertabrak. Hati nurani Aya tidak sanggup menerima kenyataan bahwa dia membunuh dua teman sekelasnya dengan sihir, dan dia mati-matian berusaha memahami situasinya. Namun, ketika dia kembali dalam masalah, dia diselamatkan oleh Tsuyuno Yatsumura, teman sekelas yang bisa menggunakan sihir untuk menghentikan waktu. Duo ini memiliki banyak hal yang harus dilakukan: tidak hanya mereka harus bertarung bersama dan melawan gadis-gadis penyihir lainnya, tetapi mereka juga perlu mengungkap kebenaran di balik situs web tersebut dan peristiwa apokaliptik yang dikenal sebagai "The Tempest" yang akan segera terjadi.
Duh, kasihan Aya-chan! Tapi kekuatan sihirnya keren juga, semoga dia bisa jadi kuat dan bahagia, nyaa~ (≧∇≦)/
