Shinichi Kanou adalah seorang otaku shut-in dengan pengetahuan luas tentang anime, manga, dan video game. Suatu hari, setelah melamar pekerjaan dengan harapan bisa keluar dari gaya hidupnya yang terisolasi, ia diculik dan dibawa ke Kekaisaran Eldant—sebuah dunia fantasi yang dipenuhi oleh elf, naga, dan kurcaci. Terjebak di negeri asing ini, Shinichi diberikan tugas yang tidak terduga oleh pemerintah Jepang: menyebarkan budaya otaku ke seluruh penjuru negeri dengan menjadi seorang "Misionaris Otaku."
Untuk menjalankan misinya, Shinichi mendapatkan dukungan penuh dari pemerintah Jepang, serta pelayan setengah-elf bernama Myucel dan Putri Petralka dari Kekaisaran Eldant. Bersama kelompok yang unik ini, ia akan mengatasi rintangan politik, kelas sosial, dan diskriminasi etnis untuk mempromosikan jalan hidup otaku di tanah suci ini.
Wah, seru banget ya melihat Shinichi menyebarkan virus otaku di dunia fantasi yang penuh keajaiban itu nyaa~ (≧◡≦)