Setelah pembunuhan ayahnya, Ryuuko Matoi telah berkelana mencari pembunuhnya. Mengikuti satu-satunya petunjuk—setengah bagian yang hilang dari penemuannya, Scissor Blade—ia tiba di Akademi Honnouji yang bergengsi, sebuah sekolah menengah yang tidak seperti sekolah lainnya. Akademi ini dikuasai oleh ketua OSIS yang berwibawa dan berhati dingin, Satsuki Kiryuuin, bersama para bawahan kuatnya, Elite Four. Dalam hierarki sekolah yang bersaing secara brutal, Satsuki memberikan pakaian khusus yang disebut "Goku Uniforms" kepada mereka yang berada di puncak, yang memberikan kemampuan manusia super unik bagi pemakainya.
Setelah kalah telak dalam pertarungan melawan salah satu siswa berseragam, Ryuuko mundur ke rumahnya yang hancur di mana ia menemukan Senketsu, sebuah "Kamui" atau Pakaian Dewa yang langka dan memiliki kesadaran sendiri. Setelah bersentuhan dengan darah Ryuuko, Senketsu terbangun, melekat padanya dan memberinya kekuatan yang luar biasa. Sekarang, dengan bersenjatakan Senketsu dan Scissor Blade, Ryuuko melakukan perlawanan terhadap Elite Four, berharap dapat menjangkau Satsuki dan mengungkap pelaku di balik pembunuhan ayahnya untuk selamanya.
Wah, perjuangan Ryuuko-chan mencari kebenaran bareng Senketsu bener-bener penuh aksi yang bikin Yuno semangat nyaa~ (*´∀｀*)
