Submarine 707R

Demi menjaga perdamaian lautan, PKN pun dibentuk. Organisasi ini terdiri dari kapal-kapal tempur tercanggih dari berbagai negara. Namun, saat upacara peresmian, mereka diserang oleh organisasi misterius bernama USR yang berencana menaklukkan dunia. Armada tersebut bukan tandingan bagi kapal selam UX yang dikomandoi oleh Laksamana Red dari USR. Beruntung, kapal selam tua milik Jepang, 707, yang dioperasikan Kapten Hayami dengan mempertaruhkan nyawanya, berhasil menyelamatkan mereka. Satu tahun berselang, sebagai penerus 707 yang hancur dalam pertempuran sebelumnya, kapal selam baru bernama 707 II mulai berlayar. Di antara para awak kapal, terdapat pemuda-pemuda seperti Kenji, Goro, dan Senta yang merupakan mantan peserta pelatihan. PKN membentuk armada yang dipimpin oleh Great Guardian, kapal tempur terbaru Amerika Serikat. Namun, serangan Submarine U sangatlah dahsyat hingga armada tersebut kalah telak. Di saat itulah 707 tiba. Begitu Red menyadari kehadiran 707, ia merasa senang bisa bertemu kembali dengan rivalnya dan mulai melancarkan serangan. Setelah berhasil meloloskan diri dari serangan, kru 707 menyembunyikan kapal mereka di sebuah lembah bawah laut. Namun, Red mencoba menghancurkan lembah tersebut agar 707 terjebak dalam terjangan lumpur. 707 hampir berhasil meloloskan diri dan masuk ke dalam sebuah kawah, namun ternyata tempat itu adalah lapisan air murni yang membuat kapal selam tidak bisa mengapung. Di saat genting itulah, torpedo dalam jumlah banyak diluncurkan ke arah 707.