Inazuma Eleven Go: Chrono Stone

Inazuma Eleven Go: Chrono Stone berlatar setelah Turnamen Sepak Bola Holy Road. Sang pahlawan saat ini, Tenma Matsukaze, berkelana ke seluruh Jepang untuk mengajarkan sepak bola kepada anak-anak. Ia kembali ke SMP Raimon setelah menyelesaikan misinya, namun ia terkejut karena sekolah itu bukan lagi SMP Raimon yang sama seperti yang ia ingat. Klub sepak bola sudah tidak ada, dan para anggota tim juara di Turnamen Sepak Bola Holy Road tidak memiliki ingatan tentang keikutsertaan mereka dalam turnamen tersebut. Mereka tidak mengingat Tenma maupun permainan sepak bola yang mereka cintai. Saat Tenma bingung dengan twist ini, Alpha, pemimpin Route Agents dan kapten tim Protocol Omega, tiba-tiba muncul di hadapannya. Alpha menyatakan bahwa ia dan timnya bertanggung jawab untuk melenyapkan gairah terhadap sepak bola di Raimon beserta ingatan para anggota klub sepak bola: dan Tenma sendiri adalah target berikutnya. Saat itulah seorang anak laki-laki misterius bernama Fei Rune muncul tepat pada waktunya untuk menyelamatkannya. Siapa sebenarnya Fei, dan mengapa Alpha ingin melenyapkan sepak bola selamanya? Tenma tahu bahwa ia harus melakukan segala daya kekuatannya untuk keluar sebagai pemenang. Ini adalah pertempuran yang dapat menentukan nasib sepak bola selamanya.