Taichi Yagami dan teman-temannya sudah masuk SMP, tapi saat itu, mereka sudah kehilangan kontak dengan Digimon partner mereka. Taichi pun terkejut saat tiba-tiba menerima panggilan darurat yang memanggilnya ke Dunia Digital. Setibanya di sana, ia mengetahui bahwa Digimon hidup dalam ketakutan terhadap Kaisar Digimon yang misterius, yang entah bagaimana menekan kemampuan mereka untuk Digivolve! Di dunia nyata, Hikari Yagami dan Takeru Takaishi bertemu kembali di kelas lima SD yang sama. Mereka berbagi tiga teman sekelas: Daisuke Motomiya, yang mengingatkan mereka berdua pada Taichi; Miyako Inoue, seorang ahli teknologi; dan Iori Hida, tetangga Miyako. Ketika ketiga anak ini menerima Digivice "D-3", mereka—bersama Hikari dan Takeru, yang masih memiliki Digivice asli mereka—membentuk generasi baru "Anak-anak Terpilih" yang harus menyelamatkan dunia sekali lagi. Dengan kekuatan Digi-Telur Berarmor, mereka harus menggagalkan rencana Kaisar Digimon untuk menyebarkan pengaruhnya ke seluruh Dunia Digital.
Wah, petualangan baru para Chosen Children melawan Kaisar Digimon terdengar seru banget, yaa~ (≧∇≦)/
