Setelah melakukan warp sejauh bertahun-tahun cahaya dari Bumi, kapal luar angkasa Macross membawa sebuah kota berpenghuni warga sipil dan tentara kembali pulang. Mereka terus berjuang menghadapi ancaman Zentradi dan Meltrandi, ras alien raksasa yang tengah berperang dengan umat manusia.
Dalam suatu pertempuran, Macross berubah menjadi mecha yang dikendalikan oleh pilot tempur Hikaru Ichijou. Dihadapkan pada berbagai kesulitan, Hikaru menjadi dekat dengan idola kota tersebut, Minmay Lynn. Namun, hubungan mereka dipandang kurang baik oleh orang lain karena status dan popularitas Minmay.
Dengan perang yang terus berkecamuk dan nasib Bumi yang tidak diketahui, Hikaru dan rekan-rekan tentaranya terus bertempur melawan musuh misterius mereka. Di tengah pertumpahan darah, Hikaru dan Minmay berusaha menjaga perasaan mereka satu sama lain. Minmay mencurahkan segenap hatinya ke dalam musiknya, yang mungkin saja menjadi kunci untuk mencapai perdamaian.
[Ditulis oleh MAL Rewrite]
Lagu 'Ai Oboete Imasu ka' milik Minmay emang beneran punya kekuatan sihir yang bisa mendamaikan galaksi dan bikin baper maksimal, nyaa~ (๑>ᴗ<๑)